在生物医药研究中,获取纯化的质粒DNA是一项重要步骤。首先,从过夜培养的细菌中提取50毫升的细菌液,放入50毫升离心管内,以5000g的速度离心1分钟,以收集细菌沉淀,弃去上清。重复此过程,直至每管共收集100毫升的细菌沉淀。大肠杆菌的培养通常在LB培养基中进行,建议过夜培养时间为16小时,使OD值达到2-4。离心速度建议保持在5000g(约5000rpm),若沉淀效果不佳,可适当延长离心时间,避免沉淀过于紧密,以便后续加入溶液I时更易分散。
接下来,每管加入5毫升溶液I,并重悬细菌沉淀,确保沉淀充分散开,无明显细菌团块。同时,确保溶液I中已添加RNaseA。使用最高速度的vortex搅拌10-20秒,观察悬浮液应呈均匀状态,无明显团块。如果没有vortex,可以用枪吹打沉淀以便逐渐分散。
然后,向每管中加入5毫升溶液II,轻轻颠倒离心管4-6次,并在室温下放置1-2分钟,以确保细菌完全裂解,溶液变得透明。切勿使用vortex,避免因剧烈操作导致基因组DNA断裂,从而影响最终质粒的纯度。若细菌团块或絮状物仍然存在,可再次增加颠倒次数,但总裂解时间不应超过5分钟。
随后,每管加入7毫升溶液III,轻轻颠倒离心管4-6次,使其充分混合,白色絮状物应开始形成。此时应避免使用vortex,并控制颠倒次数,以确保质粒质量不受影响。接下来的步骤是以12,000-14,000rpm的速度离心10分钟。如果离心机的最高速度较低,则需适当延长离心时间,直到沉淀充分。
将离心后的上清倒入质粒纯化柱,快速进行12,000-14,000rpm的离心2分钟,弃掉收集管内的液体,需注意保留收集管以便后续使用。如果离心后出现少量漂浮物,可选择再次离心,或使用擦镜纸自制漏斗进行过滤。
接下来,将12毫升的溶液IV加入质粒纯化柱,并在12,000-14,000rpm下一次性离心2分钟,以清除杂质。再次离心12,000-14,000rpm,时间同样为2分钟,以去除残留液体,并确保痕量的乙醇完全挥发。请注意,此步骤中,必须先弃去收集管液体,再进行离心,以彻底去除溶液IV。
最后,将质粒纯化柱放置于50毫升离心管上,按照需要加入2毫升溶液V,放置2分钟;可以选择使用重蒸水或MilliQ级纯水替代溶液V,不过水的pH需不低于6.5。如果希望获得更高浓度的质粒,可以在洗脱时使用1毫升的溶液V,通常会导致质粒得率减少5-10%。
最终,以12,000-14,000rpm的速度离心2分钟,所得到的液体即为高纯度的质粒。通常,其浓度在0.1-0.3 mg/ml范围内,适合用于细胞转染。如果需要更高浓度的质粒,可以通过异丙醇沉淀法进行进一步浓缩。使用0.7倍体积的常温异丙醇,轻轻混合后在低温下离心,注意收集上清液时避免触碰沉淀,以防质粒损失。
完成以上步骤后,您的质粒纯化过程将显著提高生物医药研究中的实验效率。我们的品牌尊龙凯时致力于为科研工作者提供高质量的实验器材及服务,助力科研项目的顺利进行。